LCOV - code coverage report
Current view: top level - configuration/driver - icedrv_restart_bgc.F90 (source / functions) Hit Total Coverage
Test: 200804-015008:4c42a82e3d:3:base,travis,quick Lines: 223 306 72.88 %
Date: 2020-08-03 20:10:57 Functions: 2 2 100.00 %

          Line data    Source code
       1             : !=========================================================================
       2             : !
       3             : ! Restart routines for the column package.
       4             : !
       5             : ! author: Elizabeth C. Hunke, LANL
       6             : !
       7             :       module icedrv_restart_bgc
       8             : 
       9             :       use icedrv_kinds
      10             :       use icedrv_constants
      11             :       use icedrv_domain_size, only: ncat, nblyr, nx
      12             :       use icepack_intfc, only: icepack_max_algae, icepack_max_doc, icepack_max_don
      13             :       use icepack_intfc, only: icepack_max_dic, icepack_max_aero, icepack_max_fe
      14             :       use icepack_intfc, only: icepack_warnings_flush, icepack_warnings_aborted
      15             :       use icepack_intfc, only: icepack_query_parameters, icepack_query_tracer_sizes
      16             :       use icepack_intfc, only: icepack_query_tracer_flags, icepack_query_tracer_indices
      17             :       use icedrv_system, only: icedrv_system_abort
      18             : 
      19             :       implicit none
      20             : 
      21             :       private
      22             :       public ::  write_restart_bgc, &
      23             :                  read_restart_bgc
      24             : 
      25             : !=======================================================================
      26             : 
      27             :       contains
      28             : 
      29             : !=======================================================================
      30             : !
      31             : ! Dumps all values needed for a bgc restart
      32             : !
      33             : ! author Elizabeth C. Hunke, LANL
      34             : 
      35          25 :       subroutine write_restart_bgc()
      36             : 
      37             :       use icedrv_arrays_column, only: Rayleigh_criteria, Rayleigh_real
      38             :       use icedrv_domain_size, only: n_algae, n_doc, n_dic
      39             :       use icedrv_domain_size, only: n_don, n_zaero, n_fed, n_fep
      40             :       use icedrv_flux, only: sss, nit, amm, sil, dmsp, dms, algalN
      41             :       use icedrv_flux, only: doc, don, dic, fed, fep, zaeros, hum
      42             :       use icedrv_state, only: trcrn
      43             :       use icedrv_restart, only:  write_restart_field
      44             : 
      45             :       ! local variables
      46             : 
      47             :       integer (kind=int_kind) :: &
      48             :        i, k             , & ! horizontal, vertical indices
      49             :        mm                   ! n_algae
      50             : 
      51             :       logical (kind=log_kind) :: skl_bgc, solve_zsal, z_tracers
      52             : 
      53             :       integer (kind=int_kind) :: nbtrcr
      54             :       logical (kind=log_kind) :: tr_bgc_Nit, tr_bgc_Am, tr_bgc_Sil, tr_bgc_hum
      55             :       logical (kind=log_kind) :: tr_bgc_DMS, tr_bgc_PON, tr_bgc_N, tr_bgc_C
      56             :       logical (kind=log_kind) :: tr_bgc_DON, tr_bgc_Fe,  tr_zaero , tr_bgc_chl
      57             :       integer (kind=int_kind) :: nt_bgc_S, nt_bgc_Nit, nt_bgc_AM, nt_bgc_Sil
      58             :       integer (kind=int_kind) :: nt_bgc_hum, nt_bgc_PON
      59             :       integer (kind=int_kind) :: nt_bgc_DMSPp, nt_bgc_DMSPd, nt_bgc_DMS
      60             :       integer (kind=int_kind) :: nt_zbgc_frac
      61             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_algae) :: nt_bgc_N
      62             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_algae) :: nt_bgc_chl
      63             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_algae) :: nt_bgc_C
      64             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_doc)   :: nt_bgc_DOC
      65             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_don)   :: nt_bgc_DON
      66             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_dic)   :: nt_bgc_DIC
      67             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_aero)  :: nt_zaero
      68             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_fe)    :: nt_bgc_Fed
      69             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_fe)    :: nt_bgc_Fep
      70             : 
      71             :       character(len=*), parameter :: subname='(write_restart_bgc)'
      72             : 
      73             :       !-----------------------------------------------------------------
      74             :       ! query Icepack values
      75             :       !-----------------------------------------------------------------
      76             : 
      77          25 :       call icepack_query_parameters(skl_bgc_out=skl_bgc)
      78          25 :       call icepack_query_parameters(solve_zsal_out=solve_zsal)
      79          25 :       call icepack_query_parameters(z_tracers_out=z_tracers)
      80          25 :       call icepack_query_tracer_sizes(nbtrcr_out=nbtrcr)
      81             :       call icepack_query_tracer_flags(tr_bgc_Nit_out=tr_bgc_Nit, & 
      82             :          tr_bgc_Am_out=tr_bgc_Am, &
      83             :          tr_bgc_Sil_out=tr_bgc_Sil, tr_bgc_hum_out=tr_bgc_hum, &
      84             :          tr_bgc_DMS_out=tr_bgc_DMS, tr_bgc_PON_out=tr_bgc_PON, &
      85             :          tr_bgc_N_out=tr_bgc_N, tr_bgc_C_out=tr_bgc_C, &
      86             :          tr_bgc_DON_out=tr_bgc_DON, tr_bgc_Fe_out=tr_bgc_Fe,  &
      87          25 :          tr_zaero_out=tr_zaero, tr_bgc_chl_out=tr_bgc_chl)
      88             :       call icepack_query_tracer_indices( nt_bgc_S_out=nt_bgc_S, &
      89             :          nt_bgc_N_out=nt_bgc_N, nt_bgc_AM_out=nt_bgc_AM, &
      90             :          nt_bgc_chl_out=nt_bgc_chl, nt_bgc_C_out=nt_bgc_C, &
      91             :          nt_bgc_DOC_out=nt_bgc_DOC, &
      92             :          nt_bgc_DIC_out=nt_bgc_DIC, nt_bgc_Nit_out=nt_bgc_Nit, &
      93             :          nt_bgc_Sil_out=nt_bgc_Sil, nt_bgc_hum_out=nt_bgc_hum, &
      94             :          nt_bgc_DMSPp_out=nt_bgc_DMSPp, nt_bgc_DMSPd_out=nt_bgc_DMSPd, &
      95             :          nt_bgc_DMS_out=nt_bgc_DMS, nt_bgc_PON_out=nt_bgc_PON, &
      96             :          nt_bgc_DON_out=nt_bgc_DON, nt_bgc_Fed_out=nt_bgc_Fed, &
      97             :          nt_bgc_Fep_out=nt_bgc_Fep, nt_zbgc_frac_out=nt_zbgc_frac, &
      98          25 :          nt_zaero_out=nt_zaero)
      99          25 :       call icepack_warnings_flush(nu_diag)
     100          25 :       if (icepack_warnings_aborted()) call icedrv_system_abort(string=subname, &
     101           0 :           file=__FILE__,line= __LINE__)
     102             : 
     103             :       !-----------------------------------------------------------------
     104             :       ! Salinity and extras
     105             :       !-----------------------------------------------------------------
     106          25 :       if (solve_zsal) then
     107             : 
     108           0 :       do k = 1, nblyr
     109           0 :         call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_S+k-1,:),ncat) 
     110             :       enddo
     111             :     
     112           0 :       call write_restart_field(nu_dump,sss,1) 
     113             : 
     114           0 :          do i = 1, nx
     115           0 :             if (Rayleigh_criteria(i)) then
     116           0 :                 Rayleigh_real    (i) = c1
     117           0 :             elseif (.NOT. Rayleigh_criteria(i)) then
     118           0 :                 Rayleigh_real    (i) = c0
     119             :             endif
     120             :          enddo
     121             : 
     122           0 :       call write_restart_field(nu_dump,Rayleigh_real,1) 
     123             : 
     124             :       endif ! solve_zsal
     125             : 
     126             :       !-----------------------------------------------------------------
     127             :       ! Skeletal layer BGC
     128             :       !-----------------------------------------------------------------
     129             : 
     130          25 :       if (skl_bgc) then
     131           4 :          do k = 1, n_algae
     132           3 :            call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_N(k),:),ncat) 
     133           3 :            if (tr_bgc_chl) &
     134           1 :            call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_chl(k),:),ncat) 
     135             :          enddo
     136           1 :          if (tr_bgc_C)  then
     137             : !           do k = 1, n_algae
     138             : !             call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_C(k),:),ncat) 
     139             : !           enddo
     140           3 :             do k = 1, n_doc
     141           3 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DOC(k),:),ncat)
     142             :             enddo
     143           1 :             do k = 1, n_dic
     144           1 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DIC(k),:),ncat)
     145             :             enddo
     146             :          endif
     147           1 :          if (tr_bgc_Nit) &
     148           1 :              call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Nit,:),ncat)
     149           1 :          if (tr_bgc_Am) &
     150           1 :              call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Am,:),ncat)
     151           1 :          if (tr_bgc_Sil) &
     152           1 :              call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Sil,:),ncat)
     153           1 :          if (tr_bgc_hum) &
     154           1 :              call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_hum,:),ncat)
     155           1 :          if (tr_bgc_DMS) then
     156           1 :             call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DMSPp,:),ncat)
     157           1 :             call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DMSPd,:),ncat)
     158           1 :             call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DMS,:),ncat)
     159             :          endif
     160           1 :          if (tr_bgc_PON) &
     161           1 :              call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_PON,:),ncat)
     162           1 :          if (tr_bgc_DON)  then
     163           2 :             do k = 1, n_don
     164           2 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DON(k),:),ncat)
     165             :             enddo
     166             :          endif
     167           1 :          if (tr_bgc_Fe )  then
     168           2 :             do k = 1, n_fed 
     169           2 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Fed(k),:),ncat)
     170             :             enddo
     171           2 :             do k = 1, n_fep 
     172           2 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Fep(k),:),ncat)
     173             :             enddo
     174             :          endif
     175             : 
     176          24 :       elseif (z_tracers) then
     177             : 
     178             :       !-----------------------------------------------------------------
     179             :       ! Z layer BGC
     180             :       !-----------------------------------------------------------------
     181             : 
     182          24 :          if (tr_bgc_Nit) then
     183          24 :             write(nu_diag,*) 'z bgc restart: min/max Nitrate'
     184         264 :             do k = 1, nblyr+3
     185         264 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Nit+k-1,:),ncat)
     186             :             enddo
     187             :          endif
     188          24 :          if (tr_bgc_N) then
     189          96 :             do mm = 1, n_algae
     190         792 :                do k = 1, nblyr+3
     191         792 :                   call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_N(mm)+k-1,:),ncat)
     192             :                enddo
     193          96 :                if (tr_bgc_chl) then
     194           0 :                   do k = 1, nblyr+3
     195           0 :                      call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_chl(mm)+k-1,:),ncat)
     196             :                   enddo
     197             :                endif
     198             :             enddo   ! n_algae
     199             :          endif      ! tr_bgc_N
     200          24 :          if (tr_bgc_C) then
     201             : ! algal C is not yet distinct from algal N
     202             : !           do mm = 1, n_algae
     203             : !           do k = 1, nblyr+3
     204             : !              call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_C(mm)+k-1,:),ncat)
     205             : !           enddo
     206             : !           enddo
     207          72 :             do mm = 1, n_doc
     208         552 :             do k = 1, nblyr+3
     209         528 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DOC(mm)+k-1,:),ncat)
     210             :             enddo
     211             :             enddo
     212          24 :             do mm = 1, n_dic
     213          24 :             do k = 1, nblyr+3
     214           0 :               call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DIC(mm)+k-1,:),ncat)
     215             :             enddo
     216             :             enddo
     217             :          endif  !tr_bgc_C
     218          24 :          if (tr_bgc_Am) then
     219         264 :             do k = 1, nblyr+3
     220         264 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Am+k-1,:),ncat)
     221             :             enddo
     222             :          endif
     223          24 :          if (tr_bgc_Sil) then
     224         264 :             do k = 1, nblyr+3
     225         264 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Sil+k-1,:),ncat)
     226             :             enddo
     227             :          endif
     228          24 :          if (tr_bgc_hum) then
     229         264 :             do k = 1, nblyr+3
     230         264 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_hum+k-1,:),ncat)
     231             :             enddo
     232             :          endif
     233          24 :          if (tr_bgc_DMS) then
     234         264 :             do k = 1, nblyr+3
     235         240 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DMSPp+k-1,:),ncat)
     236         240 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DMSPd+k-1,:),ncat)
     237         264 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DMS+k-1,:),ncat)
     238             :             enddo
     239             :          endif
     240          24 :          if (tr_bgc_PON) then
     241         264 :             do k = 1, nblyr+3
     242         264 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_PON+k-1,:),ncat)
     243             :             enddo
     244             :          endif
     245          24 :          if (tr_bgc_DON) then
     246          48 :             do mm = 1, n_don
     247         288 :             do k = 1, nblyr+3
     248         264 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_DON(mm)+k-1,:),ncat)
     249             :             enddo
     250             :             enddo
     251             :          endif
     252          24 :          if (tr_bgc_Fe ) then
     253           2 :             do mm = 1, n_fed
     254          12 :             do k = 1, nblyr+3
     255          11 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Fed(mm)+k-1,:),ncat)
     256             :             enddo
     257             :             enddo
     258           2 :             do mm = 1, n_fep
     259          12 :             do k = 1, nblyr+3
     260          11 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_bgc_Fep(mm)+k-1,:),ncat)
     261             :             enddo
     262             :             enddo
     263             :          endif
     264          24 :          if (tr_zaero) then
     265         161 :             do mm = 1, n_zaero
     266        1541 :             do k = 1, nblyr+3
     267        1518 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_zaero(mm)+k-1,:),ncat)
     268             :             enddo
     269             :             enddo
     270             :          endif
     271          24 :          if (nbtrcr > 0) then
     272         500 :             do mm = 1, nbtrcr
     273         500 :                call write_restart_field(nu_dump,trcrn(:,nt_zbgc_frac+mm-1,:),ncat)
     274             :             enddo
     275             :          endif
     276             : 
     277             :       !-----------------------------------------------------------------
     278             :       ! Ocean BGC
     279             :       !-----------------------------------------------------------------
     280             : 
     281          24 :          if (tr_bgc_N) then
     282          96 :             do k = 1, n_algae
     283          96 :                call write_restart_field(nu_dump,algalN(:,k),1)
     284             :             enddo  ! k
     285             :          endif
     286          24 :          if (tr_bgc_C) then
     287          72 :             do k = 1, n_doc
     288          72 :                call write_restart_field(nu_dump,doc(:,k),1)
     289             :             enddo  ! k
     290          24 :             do k = 1, n_dic
     291          24 :                call write_restart_field(nu_dump,dic(:,k),1)
     292             :             enddo  ! k
     293             :          endif      
     294          24 :          if (tr_bgc_Nit) &
     295          24 :              call write_restart_field(nu_dump,nit,1)
     296          24 :          if (tr_bgc_Am) &
     297          24 :              call write_restart_field(nu_dump,amm,1)
     298          24 :          if (tr_bgc_Sil) &
     299          24 :              call write_restart_field(nu_dump,sil,1)
     300          24 :          if (tr_bgc_hum) &
     301          24 :              call write_restart_field(nu_dump,hum,1)
     302          24 :          if (tr_bgc_DMS) then
     303          24 :              call write_restart_field(nu_dump,dmsp,1)
     304          24 :              call write_restart_field(nu_dump,dms,1)
     305             :          endif
     306          24 :          if (tr_bgc_DON) then
     307          48 :             do k = 1, n_don
     308          48 :                call write_restart_field(nu_dump,don(:,k),1)
     309             :             enddo  ! k
     310             :          endif
     311          24 :          if (tr_bgc_Fe ) then
     312           2 :             do k = 1, n_fed
     313           2 :                call write_restart_field(nu_dump,fed(:,k),1)
     314             :             enddo  ! k
     315           2 :             do k = 1, n_fep
     316           2 :                call write_restart_field(nu_dump,fep(:,k),1)
     317             :             enddo  ! k
     318             :          endif
     319          24 :          if (tr_zaero) then
     320         161 :             do k = 1, n_zaero
     321         161 :                call write_restart_field(nu_dump,zaeros(:,k),1)
     322             :             enddo  ! k
     323             :          endif
     324             : 
     325             :       endif  ! skl_bgc or z_tracers
     326             : 
     327          25 :       end subroutine write_restart_bgc
     328             : 
     329             : !=======================================================================
     330             : !
     331             : ! Reads all values needed for a bgc restart
     332             : !
     333             : ! author Elizabeth C. Hunke, LANL
     334             : 
     335           1 :       subroutine read_restart_bgc()
     336             : 
     337             :       use icedrv_arrays_column, only: Rayleigh_real, Rayleigh_criteria
     338             :       use icedrv_domain_size, only: n_algae, n_doc, n_dic
     339             :       use icedrv_domain_size, only: n_don, n_zaero, n_fed, n_fep
     340             :       use icedrv_flux, only: sss, nit, amm, sil, dmsp, dms, algalN
     341             :       use icedrv_flux, only: doc, don, dic, fed, fep, zaeros, hum
     342             :       use icedrv_state, only: trcrn
     343             :       use icedrv_restart, only: read_restart_field
     344             : 
     345             :       ! local variables
     346             : 
     347             :       integer (kind=int_kind) :: &
     348             :          i, k, & ! indices
     349             :          mm      ! n_algae
     350             : 
     351             :       logical (kind=log_kind) :: skl_bgc, solve_zsal, z_tracers
     352             : 
     353             :       integer (kind=int_kind) :: nbtrcr
     354             :       logical (kind=log_kind) :: tr_bgc_Nit, tr_bgc_Am, tr_bgc_Sil, tr_bgc_hum
     355             :       logical (kind=log_kind) :: tr_bgc_DMS, tr_bgc_PON, tr_bgc_N, tr_bgc_C
     356             :       logical (kind=log_kind) :: tr_bgc_DON, tr_bgc_Fe,  tr_zaero , tr_bgc_chl
     357             :       integer (kind=int_kind) :: nt_bgc_S, nt_bgc_Nit, nt_bgc_AM, nt_bgc_Sil
     358             :       integer (kind=int_kind) :: nt_bgc_hum, nt_bgc_PON
     359             :       integer (kind=int_kind) :: nt_bgc_DMSPp, nt_bgc_DMSPd, nt_bgc_DMS
     360             :       integer (kind=int_kind) :: nt_zbgc_frac
     361             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_algae) :: nt_bgc_N
     362             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_algae) :: nt_bgc_chl
     363             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_algae) :: nt_bgc_C
     364             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_doc)   :: nt_bgc_DOC
     365             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_don)   :: nt_bgc_DON
     366             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_dic)   :: nt_bgc_DIC
     367             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_aero)  :: nt_zaero
     368             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_fe)    :: nt_bgc_Fed
     369             :       integer (kind=int_kind), dimension(icepack_max_fe)    :: nt_bgc_Fep
     370             : 
     371             :       character(len=*), parameter :: subname='(read_restart_bgc)'
     372             : 
     373             :       !-----------------------------------------------------------------
     374             :       ! query Icepack values
     375             :       !-----------------------------------------------------------------
     376             : 
     377           1 :       call icepack_query_parameters(skl_bgc_out=skl_bgc)
     378           1 :       call icepack_query_parameters(solve_zsal_out=solve_zsal)
     379           1 :       call icepack_query_parameters(z_tracers_out=z_tracers)
     380           1 :       call icepack_query_tracer_sizes(nbtrcr_out=nbtrcr)
     381             : 
     382             : 
     383             :       call icepack_query_tracer_flags(tr_bgc_Nit_out=tr_bgc_Nit, & 
     384             :          tr_bgc_Am_out=tr_bgc_Am, &
     385             :          tr_bgc_Sil_out=tr_bgc_Sil, tr_bgc_hum_out=tr_bgc_hum, &
     386             :          tr_bgc_DMS_out=tr_bgc_DMS, tr_bgc_PON_out=tr_bgc_PON, &
     387             :          tr_bgc_N_out=tr_bgc_N, tr_bgc_C_out=tr_bgc_C, &
     388             :          tr_bgc_DON_out=tr_bgc_DON, tr_bgc_Fe_out=tr_bgc_Fe,  &
     389           1 :          tr_zaero_out=tr_zaero, tr_bgc_chl_out=tr_bgc_chl)
     390             :       call icepack_query_tracer_indices( nt_bgc_S_out=nt_bgc_S, &
     391             :          nt_bgc_N_out=nt_bgc_N, nt_bgc_AM_out=nt_bgc_AM, &
     392             :          nt_bgc_chl_out=nt_bgc_chl, nt_bgc_C_out=nt_bgc_C, &
     393             :          nt_bgc_DOC_out=nt_bgc_DOC, &
     394             :          nt_bgc_DIC_out=nt_bgc_DIC, nt_bgc_Nit_out=nt_bgc_Nit, &
     395             :          nt_bgc_Sil_out=nt_bgc_Sil, nt_bgc_hum_out=nt_bgc_hum, &
     396             :          nt_bgc_DMSPp_out=nt_bgc_DMSPp, nt_bgc_DMSPd_out=nt_bgc_DMSPd, &
     397             :          nt_bgc_DMS_out=nt_bgc_DMS, nt_bgc_PON_out=nt_bgc_PON, &
     398             :          nt_bgc_DON_out=nt_bgc_DON, nt_bgc_Fed_out=nt_bgc_Fed, &
     399             :          nt_bgc_Fep_out=nt_bgc_Fep, nt_zbgc_frac_out=nt_zbgc_frac, &
     400           1 :          nt_zaero_out=nt_zaero)
     401           1 :       call icepack_warnings_flush(nu_diag)
     402           1 :       if (icepack_warnings_aborted()) call icedrv_system_abort(string=subname, &
     403           0 :           file=__FILE__,line= __LINE__)
     404             : 
     405             :       !-----------------------------------------------------------------
     406             :       ! Salinity and extras
     407             :       !-----------------------------------------------------------------
     408             : 
     409           1 :       if (solve_zsal) then
     410             : 
     411           0 :          write(nu_diag,*)'zSalinity restart'
     412           0 :          do k = 1, nblyr
     413           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_S+k-1,:),ncat)
     414             :          enddo
     415             :  
     416           0 :          write(nu_diag,*) 'min/max sea surface salinity'
     417           0 :          call read_restart_field(nu_restart,sss,1)
     418           0 :          write(nu_diag,*) 'min/max Rayleigh'
     419           0 :          call read_restart_field(nu_restart,Rayleigh_real,1)
     420             : 
     421           0 :          do i = 1, nx  
     422           0 :             if (Rayleigh_real     (i) .GE. c1) then
     423           0 :                 Rayleigh_criteria (i) = .true.
     424           0 :             elseif (Rayleigh_real (i) < c1) then
     425           0 :                 Rayleigh_criteria (i) = .false.
     426             :             endif
     427             :          enddo
     428             : 
     429             :       endif ! solve_zsal
     430             : 
     431             :       !-----------------------------------------------------------------
     432             :       ! Skeletal Layer BGC
     433             :       !-----------------------------------------------------------------
     434             : 
     435           1 :       if (skl_bgc) then
     436           0 :          write(nu_diag,*) 'skl bgc restart'
     437             : 
     438           0 :          write (nu_diag,*) 'min/max algal N, chl'
     439           0 :          do k = 1, n_algae
     440           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_N(k),:),ncat)
     441           0 :             if (tr_bgc_chl) &
     442           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_chl(k),:),ncat)
     443             :          enddo   ! k
     444           0 :          if (tr_bgc_C) then
     445             : ! algal C is not yet distinct from algal N
     446             : !           write (nu_diag,*) 'min/max algal C, DOC, DIC'
     447             : !           do k = 1, n_algae
     448             : !              call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_C(k),:),ncat)
     449             : !           enddo
     450           0 :             write (nu_diag,*) 'min/max DOC, DIC'
     451           0 :             do k = 1, n_doc
     452           0 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DOC(k),:),ncat)
     453             :             enddo
     454           0 :             do k = 1, n_dic
     455           0 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DIC(k),:),ncat)
     456             :             enddo
     457             :          endif
     458           0 :          write (nu_diag,*) 'min/max Nit, Am, Sil, hum'
     459           0 :          if (tr_bgc_Nit) &
     460           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Nit,:),ncat)
     461           0 :          if (tr_bgc_Am) &
     462           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Am,:),ncat)
     463           0 :          if (tr_bgc_Sil) &
     464           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Sil,:),ncat)
     465           0 :          if (tr_bgc_hum) &
     466           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_hum,:),ncat)
     467           0 :          if (tr_bgc_DMS) then
     468           0 :             write (nu_diag,*) 'min/max pDMSP, dDMSP, DMS'
     469           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DMSPp,:),ncat)
     470           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DMSPd,:),ncat)
     471           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DMS,:),ncat)
     472             :          endif
     473           0 :          write (nu_diag,*) 'min/max PON'
     474           0 :          if (tr_bgc_PON) &
     475           0 :             call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_PON,:),ncat)
     476           0 :          if (tr_bgc_DON) then
     477           0 :             write (nu_diag,*) 'min/max DON'
     478           0 :             do k = 1, n_don
     479           0 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DON(k),:),ncat)
     480             :             enddo
     481             :          endif
     482           0 :          if (tr_bgc_Fe) then
     483           0 :             write (nu_diag,*) 'min/max dFe, pFe'
     484           0 :             do k = 1, n_fed 
     485           0 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Fed (k),:),ncat)
     486             :             enddo
     487           0 :             do k = 1, n_fep 
     488           0 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Fep (k),:),ncat)
     489             :             enddo
     490             :          endif
     491             : 
     492           1 :       elseif (z_tracers) then
     493             : 
     494             :       !-----------------------------------------------------------------
     495             :       ! Z Layer BGC
     496             :       !-----------------------------------------------------------------
     497             : 
     498           1 :          if (tr_bgc_Nit) then
     499           1 :             write(nu_diag,*) 'z bgc restart: min/max Nitrate'
     500          11 :             do k=1, nblyr+3
     501          11 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Nit+k-1,:),ncat)
     502             :             enddo
     503             :          endif   ! Nit
     504           1 :          if (tr_bgc_N) then
     505           4 :             do mm = 1, n_algae
     506           3 :                write(nu_diag,*) ' min/max Algal N', n_algae
     507          33 :                do k=1, nblyr+3
     508          33 :                   call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_N(mm)+k-1,:),ncat)
     509             :                enddo
     510           4 :                if (tr_bgc_chl) then
     511           0 :                   write(nu_diag,*) ' min/max Algal chla'
     512           0 :                   do k=1, nblyr+3
     513           0 :                      call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_chl(mm)+k-1,:),ncat)
     514             :                   enddo
     515             :                endif   ! tr_bgc_chl
     516             :             enddo      ! n_algae
     517             :          endif         ! tr_bgc_N
     518           1 :          if (tr_bgc_C) then
     519             : ! algal C is not yet distinct from algal N
     520             : !           do mm = 1, n_algae
     521             : !              write(nu_diag,*) ' min/max algalC'
     522             : !              do k=1, nblyr+3
     523             : !                 call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_C(mm)+k-1,:),ncat)
     524             : !              enddo
     525             : !           enddo  !mm
     526           3 :             do mm = 1, n_doc
     527           2 :                write(nu_diag,*) ' min/max DOC'
     528          23 :                do k=1, nblyr+3
     529          22 :                   call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DOC(mm)+k-1,:),ncat)
     530             :                enddo
     531             :             enddo  !mm
     532           1 :             do mm = 1, n_dic
     533           0 :                write(nu_diag,*) ' min/max DIC'
     534           1 :                do k=1, nblyr+3
     535           0 :                   call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DIC(mm)+k-1,:),ncat)
     536             :                enddo
     537             :             enddo  !mm
     538             :          endif  ! tr_bgc_C
     539           1 :          if (tr_bgc_Am) then
     540           1 :             write(nu_diag,*) ' min/max ammonium'
     541          11 :             do k=1, nblyr+3
     542          11 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Am+k-1,:),ncat)
     543             :             enddo
     544             :          endif
     545           1 :          if (tr_bgc_Sil) then
     546           1 :             write(nu_diag,*) ' min/max silicate'
     547          11 :             do k=1, nblyr+3
     548          11 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Sil+k-1,:),ncat)
     549             :             enddo
     550             :          endif
     551           1 :          if (tr_bgc_hum) then
     552           1 :             write(nu_diag,*) ' min/max humic material'
     553          11 :             do k=1, nblyr+3
     554          11 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_hum+k-1,:),ncat)
     555             :             enddo
     556             :          endif
     557           1 :          if (tr_bgc_DMS) then
     558           1 :             write (nu_diag,*) 'min/max pDMSP, dDMSP, DMS'
     559          11 :             do k=1, nblyr+3
     560          10 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DMSPp+k-1,:),ncat)
     561          10 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DMSPd+k-1,:),ncat)
     562          11 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DMS+k-1,:),ncat)
     563             :             enddo
     564             :          endif
     565           1 :          if (tr_bgc_PON) then
     566           1 :             write(nu_diag,*) ' min/max PON'
     567          11 :             do k=1, nblyr+3
     568          11 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_PON+k-1,:),ncat)
     569             :             enddo
     570             :          endif
     571           1 :          if (tr_bgc_DON) then
     572           2 :             do mm = 1, n_don
     573           1 :                write(nu_diag,*) ' min/max DON'
     574          12 :                do k=1, nblyr+3
     575          11 :                   call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_DON(mm)+k-1,:),ncat)
     576             :                enddo
     577             :             enddo  !mm
     578             :          endif
     579           1 :          if (tr_bgc_Fe) then
     580           0 :             do mm = 1, n_fed
     581           0 :                write(nu_diag,*) ' min/max dFe '
     582           0 :                do k=1, nblyr+3
     583           0 :                   call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Fed (mm)+k-1,:),ncat)
     584             :                enddo
     585             :             enddo  !mm
     586           0 :             do mm = 1, n_fep
     587           0 :                write(nu_diag,*) ' min/max pFe '
     588           0 :                do k=1, nblyr+3
     589           0 :                   call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_bgc_Fep (mm)+k-1,:),ncat)
     590             :                enddo
     591             :             enddo  !mm
     592             :          endif
     593           1 :          if (tr_zaero) then
     594           7 :             do mm = 1, n_zaero
     595           6 :                write(nu_diag,*) ' min/max z aerosols'
     596          67 :                do k=1, nblyr+3
     597          66 :                   call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_zaero(mm)+k-1,:),ncat)
     598             :                enddo
     599             :             enddo  !mm
     600             :          endif
     601           1 :          if (nbtrcr > 0) then
     602           1 :             write (nu_diag,*) 'min/max zbgc_frac'
     603          21 :             do mm = 1, nbtrcr
     604          21 :                call read_restart_field(nu_restart,trcrn(:,nt_zbgc_frac+mm-1,:),ncat)
     605             :             enddo
     606             :          endif
     607             : 
     608             :       !-----------------------------------------------------------------
     609             :       ! Ocean BGC
     610             :       !-----------------------------------------------------------------
     611             : 
     612           1 :          write(nu_diag,*) 'mixed layer ocean bgc restart'
     613           1 :          if (tr_bgc_N) then
     614           1 :             write (nu_diag,*) 'min/max algalN'
     615           4 :             do k = 1, n_algae
     616           4 :                call read_restart_field(nu_restart,algalN(:,k),1)
     617             :             enddo  ! k
     618             :          endif
     619           1 :          if (tr_bgc_C) then
     620           1 :             write (nu_diag,*) 'min/max DOC, DIC'
     621           3 :             do k = 1, n_doc
     622           3 :                call read_restart_field(nu_restart,doc(:,k),1)
     623             :             enddo  ! k
     624           1 :             do k = 1, n_dic
     625           1 :                call read_restart_field(nu_restart,dic(:,k),1)
     626             :             enddo  ! k
     627             :          endif  !tr_bgc_C
     628             : 
     629           1 :          write (nu_diag,*) 'min/max Nit, Am, Sil, hum, DMSP, DMS'
     630           1 :          if (tr_bgc_Nit) &
     631           1 :             call read_restart_field(nu_restart,nit,1)
     632           1 :          if (tr_bgc_Am) &
     633           1 :             call read_restart_field(nu_restart,amm ,1)
     634           1 :          if (tr_bgc_Sil) &
     635           1 :             call read_restart_field(nu_restart,sil,1)
     636           1 :          if (tr_bgc_hum) &
     637           1 :             call read_restart_field(nu_restart,hum,1)
     638           1 :          if (tr_bgc_DMS) then
     639           1 :             call read_restart_field(nu_restart,dmsp,1)
     640           1 :             call read_restart_field(nu_restart,dms,1)
     641             :          endif
     642           1 :          if (tr_bgc_DON) then
     643           1 :             write (nu_diag,*) 'min/max DON'
     644           2 :             do k = 1, n_don
     645           2 :                call read_restart_field(nu_restart,don(:,k),1)
     646             :             enddo  ! k
     647             :          endif
     648           1 :          if (tr_bgc_Fe ) then
     649           0 :             write (nu_diag,*) 'min/max dFe, pFe'
     650           0 :             do k = 1, n_fed
     651           0 :                call read_restart_field(nu_restart,fed(:,k),1)
     652             :             enddo  ! k
     653           0 :             do k = 1, n_fep
     654           0 :                call read_restart_field(nu_restart,fep(:,k),1)
     655             :             enddo  ! k
     656             :          endif
     657           1 :          if (tr_zaero) then
     658           1 :             write (nu_diag,*) 'min/max zaeros'
     659           7 :             do k = 1, n_zaero
     660           7 :                call read_restart_field(nu_restart,zaeros(:,k),1)
     661             :             enddo  ! k
     662             :          endif
     663             : 
     664             :       endif  ! skl_bgc or z_tracers
     665             :    
     666           1 :       end subroutine read_restart_bgc
     667             : 
     668             : !=======================================================================
     669             : 
     670             :       end module icedrv_restart_bgc
     671             : 
     672             : !=======================================================================

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